1948 ജനുവരി 30ന് വി പി മുഹമ്മദലി ഹാജി സാഹിബ് അമീറായി നിലവില്‍ വന്ന കേരളത്തിലെ ജമാഅത്തെ ഇസ്‌ലാമിക്ക് കെട്ടുറപ്പുള്ള സംഘടനാ സംവിധാനമുണ്ട്. എസ് ഐ ഒ (വിദ്യാര്‍ഥി വിഭാഗം), ജി ഐ ഒ (വനിതാവിഭാഗം), സോളിഡാരിററി (യുവജന വിഭാഗം), ബാലസംഘം എന്നിവയും കീഴ്ഘടകങ്ങളായി പ്രവര്‍ത്തിക്കുന്നു.

പ്രബോധനം, ബോധനം, ആരാമം, മലര്‍വാടി തുടങ്ങിയ സംഘടനാ പ്രസിദ്ധീകരണങ്ങള്‍ക്ക് പുറമെ മാധ്യമം ദിനപത്രം, ആഴ്ചപ്പതിപ്പ്, മീഡിയാവണ്‍ ചാനല്‍ എന്നിവയും ജമാഅത്തെ ഇസ്‌ലാമിക്ക് കീഴില്‍ പ്രവര്‍ത്തിക്കുന്നു. അഞ്ഞൂറിലധികം പുസ്തകങ്ങള്‍ പുറത്തിറക്കിയ ഇസ്‌ലാമിക് പബ്ലിഷിങ് ഹൗസ്, ഖുര്‍ആന്‍ സ്റ്റഡി സെന്റര്‍, ബൈത്തുസ്സകാത്ത്, മജ്‌ലിസുത്തഅ്‌ലീമില്‍ ഇസ്‌ലാമി തുടങ്ങി നിരവധി സംരംഭങ്ങളും നടത്തിവരുന്നു. ഇസ്‌ലാമിക് യൂണിവേഴ്‌സിറ്റി, നിരവധി കോളേജുകള്‍, ആശുപത്രികള്‍, റിലീഫ് വിംഗ് എന്നിവയും ജമാഅത്ത് നേരിട്ടു നടത്തുന്നുണ്ട്.

അമീറുള്‍പ്പെടെ 25 പേരടങ്ങുന്ന ശൂറാ (കൂടിയാലോചന സമിതി) യാണ് കാര്യങ്ങള്‍ തീരുമാനിക്കുക. കോഴിക്കോട് ഹിറാ സെന്റര്‍ ആണ് സംസ്ഥാന കാര്യാലയം.